NIA की क्लीन चिट के बावजूद साध्वी प्रज्ञा सिंह ठाकुर को जमानत नहीं मिली। विशेष कोर्ट ने 2008 के मालेगांव बम धमाके की आरोपी साध्वी प्रज्ञा की ज़मानत अर्ज़ी ख़ारिज कर दी है। धमाके में मारे गए लोगों के परिवार वालों ने प्रज्ञा सिंह ठाकुर की ज़मानत का विरोध किया था।