हाथरस गैंगरेप मामले में आगरा की फोरेंसिक रिपोर्ट को लेकर कई सवाल खड़े हो गए हैं. रिपोर्ट के अनुसार घटना में बलात्कार की पुष्टि नहीं हुई है. वारदात के 11 दिन बाद सैंपल फोरेंसिक जांच के लिए पहुंचे थे.फोरेंसिक एक्सपर्ट की मानें तो इतने दिन बाद वैजाइनल सैंपल की जांच करने पर कोई नतीजा नहीं आ सकता है. वारदात के 48 घण्टे में सैंपल लिए जाएं तो कोई नतीजा आ सकता था, चूंकि देरी से स्पर्म खत्म हो जाते है.
22 सितंम्बर को अलीगढ़ के जेएन मेडिकल कॉलेज में पीड़ित के बयान के बाद उसकी जांच की गई थी. उस जांच में सेक्सुअल असॉल्ट की बात नहीं कही गयी थी.