यमुना नदी का जलस्तर बढ़ने से ताजमहल के निकट बाढ़ का खतरा उत्पन्न हो गया है और प्रशासन सतर्क है. यमुना का जल ताजमहल की नींव की लकड़ी को नम रखकर उसकी मजबूती बनाए रखने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है. नदी का प्रदूषित जल संगमरमर की सतह को नुकसान पहुंचा सकता है और ताजमहल के लिए खतरा भी बन सकता है.