ISI की S1 यूनिट भारत के खिलाफ आतंकी हमलों की मास्टरमाइंड है और इसका मुख्यालय इस्लामाबाद में है S1 यूनिट को दो कर्नल रैंक के अफसर गाजी 1 और गाजी 2 लीड करते हैं और यह ड्रग्स के पैसों से फंड होती है इस यूनिट के सदस्यों को बम, आईईडी बनाने और हथियार चलाने में विशेषज्ञता प्राप्त होती है